La historia de este departamento se remonta a los bellos y recordados tiempos de la colonia; durante este tiempo se dependía de la provincia de Chiquimula que estuvo dividida en dos partidos o corregimientos que eran; uno, Zacapa Y Acasaguastlán, formado por los ocho pueblos y valles, situados en la región de occidente y el otro llamado Chiquimula, que comprendía los vendidos de la parte oriente.
En 1,825, Chiquimula se convirtió en Departamento, contando con siete municipios siendo Zacapa uno de ellos; debido a la extensión territorial de Chiquimula, la acción de las autoridades de este entonces determinaron que era muy difícil administrar un gran territorio y decidió dividir en el departamento en dos; el de Chiquimula propiamente y el de Zacapa, que tuvo como cabecera el mismo nombre; esta división se llevo a cabo por el Decreto No. 31 con fecha 10 de noviembre de 1871, del Presidente de la República General Miguel García Granados.
Al principio fue un pequeño caserío compuesto de unas pocas casas pero luego debido a los buenos pastos para el ganado y sus obrajes de añil se fue poblando rápidamente, llegando así a adquirir importancia comercial por lo que la llevo a convertirse en ciudad en noviembre de 1896.
Este año Zacapa celebro sus 139 años de haber sido elevado a la categoria de departamento, por lo que la celebración de este aniversario que organizo la comuna zacapaneca fue una tarde-noche recreativa y bailable para la población, actividad que se realizo frente al edificio edil, donde actuaron diversos artistas locales y nacionales, asi tambien fueron presentadas oficialmente las aspirantes a flor de Feria Zacapa 2010-2011.
